关于国家出资企业中股东职务侵占的认定与赔偿方法，以下是我的详细解答：
职务侵占的认定
在判断是否构成股东职务侵占罪时，我们需关注以下几个关键因素：
主体：涉嫌此类犯罪的主体必须是公司、企业或其他单位的职员。特别地，若在国有公司、企业或其他国有单位工作的职员，以及被国有单位派遣至非国有单位进行公务活动的人员存在利用职务之便实施侵占行为，则应以贪污罪论处。
主观意图：行为人必须具有故意侵占公司财产的意图。
客观行为：行为人须利用其职务上的便利，如主管、管理、经营、经手等职权，将本单位的财产非法据为己有。这包括将基于职务管理的单位财物非法占为己有，以及利用职务之便进行盗窃、诈骗等违法行为。
侵占金额：侵占的财物必须达到一定金额标准，根据相关司法解释，该金额应在人民币六万元以上方可视为数额较大。
赔偿方法
若股东被认定为职务侵占，其需承担以下赔偿责任：
直接经济损失：对公司的直接经济损失，如侵占的资金、财物等，必须依法返还。若存在违法所得，也需追缴并返还给公司。
间接损失赔偿：因职务侵占造成的间接损失，如公司因资金被侵占而无法正常运营导致的商业机会损失，法院会综合过错程度、因果关系等多方面因素判定赔偿范围。
赔偿方式：赔偿方式包括直接返还财物、支付等额款项等。若行为人无力一次性支付，可分期支付，具体由司法机关依案件情况判定。
综上所述，国家出资企业中股东职务侵占的认定需综合考虑主体、主观意图、客观行为及侵占金额等因素，而赔偿方法则包括直接经济损失的返还、间接损失的赔偿以及具体的赔偿方式。若您或您的公司遭遇此类问题，建议尽快咨询专业律师，以便得到更具体的法律建议和帮助。