合同中“三个月之内离职要扣20%工资”的条款，在大多数情况下是不合法的。下面我将从法律角度详细解释这一结论。
法律分析
劳动者权益保护：
- 根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者享有取得劳动报酬的权利，且工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得无故克扣或拖欠。
- 劳动者依法享有辞职权，只需按照法定程序履行通知义务即可解除劳动合同。在此情况下，用人单位无权以“三个月之内离职扣工资”为由进行扣减。
合同条款的合法性：
- 合同中关于离职扣款的条款，如果侵犯了劳动者的合法权益，如上述的辞职权和取得劳动报酬权，那么这样的条款很可能被视为不合法或无效。
- 除非合同条款的制定符合劳动法的相关规定，且目的是为了保护公司的合法权益（如商业机密、防止员工突然离职给公司造成重大损失），并且扣款的幅度和条件合理，否则这样的条款在大多数情况下是不被认可的。
实际操作中的风险：
- 即使合同条款看似合理，但在实际操作中仍需谨慎对待。因为一旦引发纠纷，法院或仲裁机构将依据具体案情和法律规定进行综合判断。
- 对于用人单位而言，最稳妥的做法是避免在合同中设置此类可能引起争议的条款，而是通过完善内部管理制度、加强员工培训等方式来降低员工离职带来的风险。
法律建议
对于劳动者：
- 如遇此类情况，应及时咨询专业法律顾问或律师以维护自己的合法权益。
- 如果合同中有此类不合法条款，劳动者可以依法要求用人单位修改或废除该条款，并有权在离职时不被扣减工资。
对于用人单位：
- 应遵循法律规定制定合理的劳动合同条款以避免潜在的法律风险。
- 如果确实需要设置离职扣款条款，应确保其符合劳动法的相关规定，且扣款的幅度和条件合理。
- 在员工离职时，应严格按照法律规定和合同约定处理离职手续和工资支付事宜。
综上所述，“三个月之内离职要扣20%工资”的条款在大多数情况下是不合法的。劳动者和用人单位都应了解相关法律规定，并依法行事以维护各自的合法权益。如果你有任何进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，请直接向我咨询。