当事人在仲裁条款中约定仲裁费用由申请仲裁一方承担，这个约定是有效的。以下是详细分析：

1. 法律依据与约定有效性：

   • 根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，当事人有权在合同中约定仲裁费用的承担方式。只要这种约定不违反法律法规的强制性规定，就是有效的。
   • 因此，当事人在仲裁条款中明确约定仲裁费用由申请仲裁一方承担，这一约定符合法律规定，是有效的。

2. 仲裁费用承担的实践：

   • 在实践中，仲裁费用的承担方式可以灵活约定，如由败诉方承担、按比例分担等。
   • 如果合同中没有明确约定仲裁费用的承担方式，那么仲裁庭会根据仲裁结果和具体情况来确定费用的承担方。

3. 约定对仲裁程序的影响：

   • 当事人在合同中作出的关于仲裁费用承担的约定，不会影响仲裁程序的进行。
   • 即使约定了由申请仲裁一方承担费用，如果仲裁结果对申请方不利，申请方仍需按约定承担费用，但这并不影响其申请仲裁的权利和仲裁庭对案件的裁决。

综上所述，当事人在仲裁条款中约定仲裁费用由申请仲裁一方承担是有效的。这种约定既符合法律规定，也体现了当事人对仲裁费用承担方式的自主意愿。如果在实际操作中遇到相关问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。