对于立过一等功、二等功的军官职务犯罪的处理，首先需明确的是，无论其过往功绩如何，一旦触犯法律，都应依法追究其刑事责任。以下是具体的处理原则及流程：

1. 法律面前人人平等：根据《中华人民共和国刑法》的基本原则，所有公民在法律面前都是平等的，不因个人身份、地位或过往功绩而有所差异。因此，立过一等功、二等功的军官在职务犯罪时，同样需要接受法律的制裁。

2. 依法调查与审判：对于军官的职务犯罪，相关部门将依法进行调查，收集证据，并按照法定程序进行审判。在调查过程中，会充分考虑其过往的功绩和表现，但这并不构成减轻或免除其刑事责任的依据。

3. 功绩与处罚分开：军官的过往功绩是其在军事领域的贡献，而职务犯罪则是其个人行为的违法性。在处理时，应明确区分这两点，不因功绩而掩盖或减轻罪行，也不因罪行而抹杀其过往的功绩。

4. 量刑时的综合考量：在量刑阶段，法院会综合考虑被告人的犯罪情节、社会危害程度、认罪态度以及过往表现等因素。虽然过往功绩不是减轻刑罚的法定理由，但法院在量刑时可能会酌情考虑其对社会的贡献和认罪态度，以作出更为公正合理的判决。

综上所述，立过一等功、二等功的军官在职务犯罪时，应依法接受调查、审判，并承担相应的法律责任。处理过程中，应坚持法律面前人人平等的原则，严格依法办事，同时综合考虑被告人的各方面情况，以确保判决的公正性和合理性。如有任何具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。