关于您提出的“单位不承认工伤但是时效期过了单位会对员工怎么样”的问题，以下是我的详细解答：

结论前置：若单位未在规定时效内为员工申报工伤，且时效期已过，员工虽无法再通过行政程序认定工伤，但仍可通过与用人单位协商或提起民事诉讼等途径来维护自身权益。

详细分析：

1. 工伤认定申请时效及其后果：

   • 根据《工伤保险条例》，单位应在员工发生事故伤害或被诊断、鉴定为职业病后的30日内向社会保险行政部门提出工伤认定申请。若单位未按规定提出，员工或其近亲属、工会组织可在事故伤害发生之日或被诊断、鉴定为职业病之日起1年内自行提出。
   • 若超过此1年期限，员工一般无法再通过行政程序认定工伤，意味着无法直接享受工伤保险待遇。

2. 与用人单位的协商：

   • 尽管时效期已过，员工仍可与用人单位协商赔偿事宜。基于工作原因受伤的事实，用人单位可能需承担一定的赔偿责任。
   • 在协商过程中，员工应准备好相关证据，如劳动合同、医疗记录、工资流水等，以合理主张自己的权益。

3. 民事诉讼途径：

   • 若与用人单位协商不成，员工可以向人民法院提起民事诉讼，要求用人单位承担民事赔偿责任。这通常基于侵权责任等法律关系进行。
   • 在诉讼中，员工需举证证明用人单位存在过错、员工受到损害后果以及二者之间存在因果关系。
   • 需要注意的是，民事诉讼也有时效限制，一般为三年，自员工知道或应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

4. 后续行动建议：

   • 员工应尽快收集并整理好所有相关证据，以便在协商或诉讼中使用。
   • 若对法律程序不熟悉，建议咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。

综上所述，即使工伤认定申请时效已过，员工仍有多种途径来维护自身权益。建议员工根据具体情况选择合适的方式，并尽快采取行动。若有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。