如果工伤认定用人单位不配合，单位将承担以下责任：

1. 行政责任：劳动行政部门或社保部门发现单位不配合工伤处理时，会责令其改正。如果单位在规定期限内未改正，劳动行政部门或社保部门可依法对其处以2000元以上2万元以下的罚款，以此督促单位履行应尽义务。

2. 民事责任：单位不配合会严重影响工伤认定和赔偿流程，致使职工不能及时获得赔偿。在这种情况下，原本应由工伤保险基金支付的赔偿项目，如一次性伤残补助金、工伤医疗费用等，以及因单位延误导致职工治疗不及时而造成的额外损失，都将由单位承担。

3. 刑事责任：如果单位故意阻挠工伤认定，且情节恶劣、构成犯罪，如以转移财产等方法逃避支付职工工伤赔偿，可能会构成拒不支付劳动报酬罪，从而被追究刑事责任。

面对用人单位不配合工伤认定的情况，劳动者可以采取以下措施来维护自身权益：

• 自行申请认定：劳动者可在事故伤害发生之日起1年内，直接向用人单位所在地统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。
• 准备相关材料：申请时需提交工伤认定申请表、与用人单位存在劳动关系的证明材料、医疗机构出具的诊断证明书或职业病诊断证明书等。
• 通过劳动仲裁确定劳动关系：如果用人单位拒绝提供劳动关系证明，劳动者可以通过劳动仲裁来确认劳动关系，再凭借仲裁决定书向社保部门申请工伤认定。
• 寻求法律援助：劳动者在维权过程中，如果遇到困难或问题，可以向专业律师咨询或寻求法律援助。

总之，用人单位不配合工伤认定是违法行为，将承担相应的法律责任。劳动者应依法维护自身权益，确保能获得应有的工伤赔偿和待遇。