劳动合同超期90天以上的情况，通常意味着劳动合同已经到期但双方未续签，而劳动者仍在继续工作。这种情况在法律上可能引发一系列问题，包括劳动关系的认定、劳动报酬的支付、社会保险的缴纳以及可能的经济补偿等。以下是对这一问题的全面分析：

1. 劳动关系的认定：

   • 根据《劳动合同法》的规定，劳动合同期满后，劳动者继续在用人单位工作，用人单位未表示异议的，视为双方同意以原条件继续履行劳动合同。因此，即使劳动合同超期90天以上，只要劳动者仍在工作且用人单位未提出异议，双方之间的劳动关系仍然存续。

2. 劳动报酬的支付：

   • 用人单位应当按照原劳动合同的约定，继续向劳动者支付劳动报酬。如果原劳动合同对劳动报酬没有约定或者约定不明确的，用人单位应当按照同工同酬的原则，向劳动者支付劳动报酬。

3. 社会保险的缴纳：

   • 用人单位应当继续为劳动者缴纳社会保险费，包括养老保险、医疗保险、失业保险、工伤保险和生育保险等。如果用人单位未按时足额缴纳社会保险费，劳动者可以向社会保险经办机构投诉，并要求用人单位补缴。

4. 经济补偿的可能性：

   • 如果用人单位在劳动合同超期后仍未与劳动者续签劳动合同，且劳动者因此提出解除劳动关系的，用人单位可能需要向劳动者支付经济补偿。经济补偿的具体数额，根据劳动者在用人单位的工作年限和月工资水平等因素确定。

5. 法律建议：

   • 对于劳动者而言，如果劳动合同已经超期，应及时与用人单位沟通续签事宜，以确保自己的合法权益得到保障。
   • 如果用人单位拒绝续签或拖延续签，劳动者可以保留相关证据，如工作记录、工资单等，以备将来维权之需。
   • 如果双方因劳动合同超期问题发生争议，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者依法申请劳动仲裁。

综上所述，劳动合同超期90天以上是一个需要谨慎处理的问题。无论是用人单位还是劳动者，都应当明确各自的权利和义务，并依法履行。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取法律帮助。