超过三年的诉讼时效后，如果对方同意履行，时效确实可以重新起算。以下是详细解释：

1. 法律依据与解释：

   • 根据《民法典》及相关司法解释，诉讼时效期间届满后，若义务人（即债务人）同意履行义务，则不得以诉讼时效期间届满为由进行抗辩。这意味着，只要债务人明确表示愿意履行债务，即使原本已经超过诉讼时效，诉讼时效也会从债务人作出该意思表示之日起重新计算。
   • 此外，如果债务人在诉讼时效届满后已经自愿履行了义务，那么他也不能请求返还已经履行的部分。

2. 重新起算的条件与证据：

   • 重新起算的关键在于债务人必须作出同意履行义务的意思表示。这可以是书面的，如书面承诺，也可以是口头的，但口头表示需要债权人能够提供证据来证明，如聊天记录、录音等。
   • 如果没有确凿的证据来证明债务人同意履行，那么诉讼时效可能不会重新起算。

3. 实例说明：

   • 假设小A借给小B一笔钱，还款期限届满后，小B一直未还款，且超过了三年的诉讼时效。后来，小A向小B催讨欠款时，小B明确表示会还款。此时，即使原本已经超过诉讼时效，但由于小B的同意履行意思表示，诉讼时效将从小B作出该意思表示之日起重新计算。

4. 注意事项：

   • 债权人在诉讼时效届满后应尽可能收集证据来证明债务人同意履行债务，以确保自己的权益得到保护。
   • 如果债务人在重新起算的诉讼时效期间内仍未履行债务，债权人可以依法向法院提起诉讼来维护自己的权益。

综上所述，超过三年的诉讼时效后，如果对方同意履行债务，时效确实可以重新起算。但债权人需要确保有确凿的证据来证明债务人的同意履行意思表示，并在重新起算的诉讼时效期间内及时采取行动来维护自己的权益。