关于“双方协议离职公司是否有责任”的问题，这主要取决于协议的具体内容以及离职的具体情境。以下是从几个不同角度进行的分析：
协议内容决定责任：
- 如果双方签订的离职协议中明确规定了公司的责任，比如经济补偿、工作交接、保密义务等，那么公司就需要按照协议的内容来履行相应的责任。
- 如果协议中没有明确规定公司的责任，或者只是简单地说明了离职的事实，那么公司通常就没有额外的责任需要承担。
离职原因影响责任：
- 如果离职是因为公司存在违法行为或者未履行劳动合同中的义务，导致员工被迫离职，那么公司可能需要承担一定的法律责任，比如支付经济补偿。
- 如果离职是双方协商一致的结果，且没有违反任何法律法规，那么公司通常就没有责任需要承担。
工作交接与后续责任：
- 在离职过程中，如果员工没有妥善完成工作交接，导致公司后续工作出现问题或者损失，那么员工可能需要承担一定的责任。但这与公司是否承担责任是两个不同的问题。
- 公司通常只对自己在劳动合同中的义务以及离职协议中的承诺负责。
特殊情况下的责任：
- 如果离职员工在离职后泄露了公司的商业秘密或者违反了保密协议，那么员工可能需要承担法律责任。但这同样与公司是否承担责任无关。
- 如果公司在离职过程中存在欺诈、胁迫等违法行为，那么公司可能需要承担相应的法律责任。
综上所述，双方协议离职后公司是否有责任，主要取决于协议的具体内容、离职的具体原因、工作交接的情况以及是否存在特殊情况。如果协议中明确规定了公司的责任，或者公司存在违法行为导致员工离职，那么公司就需要承担相应的责任。否则，公司通常就没有额外的责任需要承担。如果您有具体的离职协议或者相关情境需要咨询，可以直接向我提问，我会根据您的具体情况给出更详细的法律建议。