公司可以起诉员工恶意仲裁。以下是详细分析：

一. 员工恶意仲裁公司可起诉的情形

1. 滥用仲裁程序、提供虚假证据：若员工在仲裁过程中存在滥用仲裁程序、提供虚假证据等恶意行为，公司有权向法院提起诉讼，以维护自身合法权益。例如，员工无故提起高额赔偿请求，且提供的证据明显虚假，公司可据此起诉。
2. 仲裁请求缺乏事实和法律依据：在仲裁裁决作出后，如果公司认为员工的仲裁请求缺乏事实和法律依据，且存在恶意，而仲裁结果对公司不利，公司可以在法定期限内向人民法院提起诉讼，请求法院对仲裁裁决进行审查和纠正。

二. 公司起诉员工恶意仲裁的法律依据

• 从法律角度来看，恶意仲裁可能违反了仲裁的诚实信用原则。仲裁应当基于真实的争议和合法的诉求进行，而恶意仲裁则是故意利用仲裁程序来谋取不正当利益或给公司造成不必要的麻烦。公司可以提供相关证据，如员工的仲裁请求明显不合理、证据虚假等，以证明员工的恶意行为。
• 单位可以依据《民事诉讼法》等相关法律规定提起诉讼。起诉时，单位需要明确阐述员工恶意仲裁的事实和依据，请求法院驳回员工的仲裁请求，并要求其承担相应的法律责任，如赔偿单位因恶意仲裁而遭受的损失等。

三. 公司起诉员工恶意仲裁的注意事项

• 充分准备证据：公司在起诉前，必须准备充分的证据来证明员工的恶意行为，如虚假陈述、伪造证据等。这是支撑公司诉求的关键。
• 遵循法律程序：公司在起诉过程中，必须严格遵循法律程序和规定，确保自身行为的合法性。

综上所述，公司可以起诉员工恶意仲裁，但需准备充分证据，并严格遵循法律程序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。