无效协议本身不存在诉讼时效超期诉讼的问题。下面我将对此进行详细解释：

1. 无效协议的性质：

   • 无效协议自始、当然、确定无效，其无效状态不会因时间的推移而改变。
   • 请求确认协议无效是形成权的行使，不受诉讼时效的限制。

2. 基于无效协议产生的法律后果：

   • 虽然确认协议无效不受时效限制，但基于无效协议所产生的某些法律后果，如返还财产、赔偿损失等请求权，却可能受到诉讼时效的约束。
   • 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，这些请求权的诉讼时效期间一般为三年，从权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。

3. 特殊情况：

   • 对于涉及不动产物权的协议无效请求权，由于其特殊性质，通常不适用诉讼时效的规定。

4. 实例说明：

   • 假设甲乙双方签订了一份无效的房屋买卖合同，无论何时发现该合同无效，甲方或乙方都有权向法院主张确认该合同无效，这一主张不受诉讼时效的限制。
   • 但如果基于该无效合同，甲方要求乙方返还已支付的购房款，并赔偿损失，那么这一请求权就可能受到三年诉讼时效的约束。

综上所述，当事人在面对无效协议时，应明确确认协议无效本身不受诉讼时效限制，但基于无效协议产生的某些法律后果可能受到诉讼时效的约束。在主张协议无效及相应权利时，务必了解并遵循相关法律法规，以确保自身合法权益得到有效保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。