针对你提出的问题，关于在国企非法转包项目中实际干活并垫付款项的个人款项未能收回的情况，国家有关部门可以采取以下措施来协助解决：

首先，明确结论： 国家有关部门，如住房和城乡建设部门、市场监督管理部门以及劳动监察部门等，均有可能根据具体情况介入，对非法转包行为进行查处，并协助实际施工人追回垫付款项。但具体能否成功追回，还需依据实际情况和法律规定来判断。

接下来，详细分析：

1. 住房和城乡建设部门的监管：

   • 住房和城乡建设部门作为建筑行业的主管部门，有权对建筑工程的承包、转包等行为进行监管。
   • 若发现国企存在非法转包行为，该部门可依法进行查处，包括责令整改、罚款、吊销资质证书等行政处罚。
   • 在查处过程中，若实际施工人提供了充分的证据证明其垫付款项且未能收回，住房和城乡建设部门可协调相关方进行协商，或引导实际施工人通过法律途径维权。

2. 市场监督管理部门的介入：

   • 市场监督管理部门负责维护市场秩序，打击不正当竞争行为。
   • 非法转包行为可能构成不正当竞争，市场监督管理部门有权对此进行调查和处理。
   • 在处理过程中，市场监督管理部门可要求相关方提供财务记录、合同等证据材料，以核实实际施工人的垫付款项情况，并协助其追回款项。

3. 劳动监察部门的保护：

   • 若实际施工人以劳动者的身份参与工程建设，并因非法转包行为导致工资或垫付款项未能收回，可向劳动监察部门投诉。
   • 劳动监察部门将依法对投诉进行调查，若属实，将责令用人单位支付拖欠的工资或垫付款项，并可对用人单位进行行政处罚。

4. 法律途径的维权：

   • 实际施工人还可通过法律途径维权，如向法院提起民事诉讼或申请仲裁。
   • 在诉讼或仲裁过程中，实际施工人需提供充分的证据证明其垫付款项的事实以及国企非法转包的行为。
   • 若法院或仲裁机构认定实际施工人的主张成立，将判决或裁决国企支付拖欠的款项。

综上所述： 在国企非法转包项目中实际干活并垫付款项的个人款项未能收回时，国家有关部门可依法介入并协助解决。但具体能否成功追回款项，还需依据实际情况和法律规定来判断。因此，建议实际施工人在遭遇此类问题时，及时咨询专业律师或相关机构，以便更好地维护自己的合法权益。