虚开增值税专用发票的定罪是由法院来决定的。下面是关于此问题的详细解释：
定罪流程：
- 在我国，刑事案件的定罪权属于法院。检察院负责提起公诉，对犯罪嫌疑人提出指控，并提供相应的证据。
- 法院则负责审理案件，根据检察院提供的证据以及被告人的辩护，对案件进行全面、客观的审查，并最终作出是否有罪的判决。
虚开增值税专用发票罪：
- 虚开增值税专用发票罪是刑法规定的一种犯罪，主要涉及税收征管领域。
- 根据相关法律规定，虚开增值税专用发票的，根据虚开的税款数额大小，会面临不同的刑罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
法院定罪的依据：
- 法院在定罪时，会严格依据法律规定和案件事实，包括虚开税款的数额、行为人的主观故意、行为方式等。
- 法院还会综合考虑被告人的辩护意见、证据的真实性和合法性等因素，确保判决的公正性和准确性。
综上所述，虚开增值税专用发票的定罪是由法院根据法律规定和案件事实来决定的。检察院虽然负责提起公诉，但最终的定罪权在法院手中。如果你对此类问题有进一步的疑问或需要法律咨询，可以直接向我提问，我会为你提供专业的解答。