虚开增值税专用发票罪的量刑并不是由检察院决定的，而是由法院根据具体的案情和法律规定来判决。以下是对此问题的详细解答：

一、量刑的决定机关

在刑事司法程序中，检察院主要负责提起公诉，对犯罪嫌疑人进行指控，并提出相应的量刑建议。然而，最终的量刑决定权在于法院。法院会根据审理过程中查明的事实、证据以及相关的法律规定，对被告人进行量刑。

二、量刑的法律依据

虚开增值税专用发票罪的量刑主要依据《中华人民共和国刑法》第二百零五条及相关司法解释。根据该法条，对于虚开增值税专用发票或者虚开用于骗取出口退税、抵扣税款的其他发票的行为，根据情节轻重，分别处以不同年限的有期徒刑、拘役、罚金或没收财产等刑罚。

三、量刑考量因素

在量刑过程中，法院会综合考虑多种因素，包括但不限于：

1. 税款数额：虚开的税款数额是量刑的重要依据，数额越大，刑罚通常越重。
2. 犯罪情节：包括犯罪手段、社会危害程度等，这些因素会影响刑罚的轻重。
3. 被告人情况：法院还会考虑被告人的认罪态度、悔罪表现、是否有自首或立功等情节，以及是否积极退赃、赔偿损失等因素，这些因素可能对量刑产生积极影响。

四、实际操作建议

由于虚开增值税专用发票罪的量刑涉及多个法律条款和司法解释，且案件情况往往复杂多变，因此建议咨询专业律师以获取更准确的法律意见和帮助。专业律师能够根据具体案情，结合法律法规和相关司法解释，为当事人提供有针对性的法律分析和辩护策略。

综上所述，虚开增值税专用发票罪的量刑是由法院根据具体的案情和法律规定来判决的，而不是由检察院决定的。在量刑过程中，法院会综合考虑多种因素，以确保刑罚的公正性和合理性。