针对您提出的“刑事案件被扣押的财物向哪个部门申请回来”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，要明确的是，被扣押的财物能否申请回来，以及向哪个部门申请，都取决于财物的性质以及其在案件中的作用。

1. 若扣押物品与案件无关：

   • 您可以向负责该案件的侦查机关（如公安机关、检察院等）提交书面申请，要求退还被扣押的财物。
   • 在申请中，您需要详细说明物品的性质以及它与案件无关的理由。
   • 侦查机关在收到申请后，会进行核实，如果确认物品确实与案件无关，通常会在3日内解除扣押并返还给您。

2. 若物品是供犯罪所用的本人财物或违法所得：

   • 这类物品通常会被依法没收，您无法申请返回。
   • 因为这些物品是犯罪活动的一部分或来源于犯罪活动，所以法律规定应当予以没收。

3. 若物品是犯罪证据：

   • 在案件审结后，如果物品不再需要作为证据保存，那么它有可能会被返还给您。
   • 您可以联系案件的承办机关（如法院、检察院等），了解物品的状态以及返还的相关程序。
   • 通常，您需要按照承办机关的指引，提交身份证明等证明材料，并办理相应的返还手续。

综上所述，被扣押的财物能否申请回来以及向哪个部门申请，都取决于财物的具体性质和案件情况。因此，建议您在申请前仔细了解相关法律法规和程序要求，并咨询专业的法律人士以获取更准确的指导。