针对您提出的“案件判决后扣押在公安机关的财物怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，我们需要明确的是，公安机关在办理案件过程中，对于与案件有关且需要作为证据的物品，有权进行扣押。这是依据《中华人民共和国治安管理处罚法》的相关规定执行的。在扣押过程中，公安机关会会同在场见证人和被扣押物品持有人查点清楚，并当场开列清单一式二份，由调查人员、见证人和持有人签名或者盖章，以确保扣押程序的合法性和透明性。
对于扣押的财物，公安机关有妥善保管的责任，不得挪作他用。特别是对于不宜长期保存的物品，公安机关会按照有关规定及时处理，以防止物品损坏或价值减损。
在案件判决后，对于扣押的财物，公安机关会根据以下情况进行处理：
经核实属于他人合法财产的：如果扣押的财物经核实属于他人合法财产，公安机关会在登记后立即退还。这是为了保护公民的合法财产权益，确保不会因案件处理而遭受不必要的损失。
满六个月无人对该财产主张权利或者无法查清权利人的：如果扣押的财物在满六个月后无人主张权利，或者公安机关无法查清权利人，那么这些财物将会被公开拍卖或者按照国家有关规定处理。所得款项会上缴国库，以用于公共事业或国家建设。
此外，如果扣押的财物与案件无关，公安机关也会在查明后及时退还。这是为了确保扣押程序的公正性和合理性，避免对无关财物造成不必要的扣押和损失。
综上所述，案件判决后扣押在公安机关的财物，会根据其性质、归属以及法律规定进行相应的处理。公安机关会严格遵守法律法规，确保扣押财物的合法性和公正性，并保护公民的合法财产权益。如果您对扣押财物的处理有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时与公安机关联系或咨询专业律师。