关于违法招标的建工案件工程款承担问题，我可以给你一个明确的结论：一般情况下，违法招标的建工案件中的工程款，应由实际施工人根据合同约定向发包人主张，但若合同无效或存在其他特殊情况，则可能涉及更复杂的承担主体。下面我将详细为你解释这一结论。
合同有效情况下的工程款承担：
- 在建工案件中，如果虽然存在违法招标的情况，但建设工程施工合同本身被认定为有效，那么实际施工人可以依据合同的约定，向发包人（通常是建设单位或业主）主张工程款。此时，工程款的承担主体较为明确，即按照合同约定履行支付义务的发包人。
合同无效情况下的工程款承担：
- 如果违法招标导致建设工程施工合同被认定为无效，那么工程款的承担问题就变得相对复杂。在这种情况下，实际施工人仍然有权向发包人主张工程款，但可能需要通过其他法律途径来维护自己的权益，如通过诉讼或仲裁等方式。
- 此外，如果违法招标行为涉及串通投标、欺诈等违法行为，相关责任人员还可能面临法律制裁，并可能需要承担因此产生的法律责任，包括但不限于赔偿损失等。
特殊情况下的工程款承担：
- 在某些特殊情况下，如发包人明知或应知承包人存在违法招标行为而仍然与其签订合同，或者承包人因违法招标行为导致无法履行合同约定等，工程款的承担主体和方式可能会更加复杂。这时，可能需要根据具体情况进行法律分析和判断。
综上所述，违法招标的建工案件工程款承担问题并不是一个简单的法律问题，而是需要根据具体情况进行综合分析和判断。如果你遇到了类似的问题，建议你及时向我咨询，我会根据你的具体情况提供针对性的法律建议和帮助。