“靠企吃企”问题是一个严重的企业腐败现象，它损害了企业利益、职工权益，破坏了市场环境和营商环境。针对工程企业中的“靠企吃企”问题，可以从以下几个方面进行处理：

一、加强监管与自查

工程企业应加强对内部各环节的监管，特别是工程建设、市场营销、项目投资、信贷审批等关键环节。企业应组织党组织和党员领导干部认真开展自查自纠，及时发现并纠正存在的问题。同时，监管部门也应加大对工程企业的监督力度，定期开展专项检查，对发现的问题进行严肃处理。

二、完善制度与机制

1. 建立健全内部控制制度：企业应完善各项内部控制制度，明确岗位职责和权限，规范业务流程，确保各项操作合规合法。
2. 强化监督机制：企业应设立专门的纪检监察机构或内部审计部门，对内部各环节进行持续监督，及时发现并纠正违规行为。
3. 建立举报机制：鼓励员工积极举报“靠企吃企”等违规行为，对举报人给予保护和支持，并对举报线索进行认真核查和处理。

三、严肃查处与追责

对于发现的“靠企吃企”问题，企业应严肃查处，对涉案人员进行严肃处理，包括但不限于纪律处分、经济处罚、法律追究等。同时，还应追究相关人员的领导责任和监管责任，确保问题得到彻底解决。

四、加强教育与宣传

1. 开展廉洁教育：企业应加强对员工的廉洁教育，提高员工的廉洁意识和法律意识，让员工认识到“靠企吃企”的严重性和危害性。
2. 宣传典型案例：通过宣传典型案例，让员工了解“靠企吃企”的后果和代价，形成有效的震慑和警示作用。

五、推动改革与发展

在处理“靠企吃企”问题的同时，企业也应积极推动改革与发展，加强内部管理，提高运营效率，增强市场竞争力。通过改革和发展，从根本上解决“靠企吃企”等腐败问题，推动企业实现高质量发展。

综上所述，处理工程企业中的“靠企吃企”问题需要多方面的努力和措施。企业应加强监管与自查、完善制度与机制、严肃查处与追责、加强教育与宣传以及推动改革与发展等方面的工作，确保问题得到有效解决，并推动企业实现持续健康发展。