公司东西丢了，员工赔不起跑了，公司可以这样做：

1. 明确责任与损失：

   • 首先，公司需要收集确凿的证据，以证明员工对物品丢失负有直接责任。这包括监控录像、目击者证词、工作日志等。
   • 同时，准备物品的购买凭证或评估报告，以准确确定损失金额。

2. 尝试沟通协商：

   • 在掌握充分证据的基础上，与员工进行平和、坦诚的沟通，指出其责任，并尝试了解员工拒绝赔偿的具体原因。
   • 如果员工对责任无异议但经济困难，可以协商制定灵活的赔偿计划，如分期付款，以减轻员工负担。

3. 发送正式通知与提供申诉机会：

   • 若沟通无果，应向员工发出正式书面通知，详细阐述物品丢失情况、责任认定、赔偿依据及金额、期限等，并明确告知员工不按时赔偿将面临的后果。
   • 在通知中明确员工享有申诉的权利，并详细说明申诉的方式和期限。

4. 采取进一步法律措施：

   • 如果员工仍然拒绝赔偿且已经离职或逃避责任，公司可以根据实际情况，向人民法院提起民事诉讼，要求员工承担赔偿责任。在此过程中，务必准备充分的证据材料。

5. 内部管理与预防：

   • 公司应加强对员工的管理和培训，提高员工的风险意识和责任意识，避免类似事件的再次发生。
   • 同时，完善公司内部的规章制度，明确员工因职务行为导致公司财产损失应承担的赔偿责任。

法律依据：

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关法律法规，员工因故意或重大过失给公司造成经济损失的，公司有权要求员工承担赔偿责任。

处理建议：

• 在处理此类问题时，公司既要坚持原则，又要注重方式方法，尽量通过沟通协商解决问题。
• 如果协商不成，应及时采取法律措施维护自身权益。

综上所述，公司东西丢了且员工赔不起跑了的情况下，公司应首先明确责任与损失，尝试沟通协商，发送正式通知并提供申诉机会。如果员工仍然拒绝赔偿且已经离职或逃避责任，公司可以采取进一步的法律措施来维护自身权益。同时，公司也应加强内部管理与预防工作，避免类似事件的再次发生。