如果复查程序违法，当事人是可以向人民法院申请申诉的。以下是对此问题的详细分析：

一、法律依据与申诉流程

依据我国相关法律的规定，当人民法院启动的再审程序违反法律规定时，当事人有权向人民法院提出申诉，以维护自己的合法权益。申诉时，需要提交以下材料：

1. 申诉状：应写明当事人的基本情况、联系方式以及申诉的事实与理由；
2. 原法律文书：包括原一、二审判决书、裁定书等。如果案件已经过人民法院复查或再审，还应附有驳回通知书、再审决定书、再审判决书、裁定书等；
3. 其他相关材料：如有新的证据证明原判决、裁定认定的事实确有错误，应同时附有相关证据材料。如果申请人民法院调查取证，应附有相关线索或材料。

二、申诉的审查与处理

人民法院在收到申诉材料后，会进行审查。如果申诉不符合规定，人民法院会告知申诉人补充材料。申诉人对必要材料拒绝补充且无正当理由的，人民法院将不予审查。如果申诉符合规定，人民法院将依法进行处理，可能包括重新审理等。

三、注意事项

在申诉过程中，当事人应注意以下几点：

1. 及时申诉：发现再审程序违法后，应及时向人民法院提出申诉，以免错过申诉期限；
2. 准备充分材料：申诉前，应准备充分的材料以支持自己的申诉请求，包括申诉状、原法律文书、相关证据材料等；
3. 遵循法律程序：在申诉过程中，应遵循法律程序，如实陈述事实，不得伪造、篡改证据或进行其他违法行为。

综上所述，如果复查程序违法，当事人是可以向人民法院申请申诉的。在申诉过程中，应准备充分的材料并遵循法律程序，以维护自己的合法权益。如果你在此过程中有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。