首先，我们要明确的是，滥用职权发房产证这一行为，如果构成犯罪，那么它通常会受到刑法的追诉期限限制。关于是否过了追诉期，我们需要从以下几个方面来分析：
追诉期限的确定：
- 刑法的追诉期限是根据犯罪行为的法定最高刑来确定的。对于滥用职权罪，其法定最高刑可能因具体情节而异，因此追诉期限也会有所不同。
- 如果滥用职权发的房产证行为被认定为犯罪，并且其法定最高刑对应的追诉期限是15年，那么从行为结束危害持续到2020年算起，12年后被查，显然还没有超过追诉期限。
追诉期限的延长与中断：
- 在某些情况下，追诉期限可能会因为特定原因而延长或中断。例如，如果犯罪嫌疑人在追诉期限内又犯新罪，那么追诉期限会从犯新罪之日起计算。
- 另外，如果司法机关在追诉期限内已经立案或者采取了强制措施，那么追诉期限也会因此中断，并从中断之日起重新计算。
特殊情况的考虑：
- 如果滥用职权发的房产证行为涉及到的犯罪情节特别严重，或者造成了特别严重的后果，那么可能会受到更严厉的刑事处罚，包括更长的追诉期限。
- 同时，如果犯罪嫌疑人存在逃避侦查或者审判的行为，也可能会影响追诉期限的计算。
综上所述，对于滥用职权发的房产证行为结束危害持续到2020年十二年后被查是否过了追诉期的问题，我们不能一概而论。具体是否过了追诉期，需要根据该行为的法定最高刑、是否存在追诉期限的延长或中断情况、以及犯罪情节和后果等因素来综合判断。
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