结论前置：主管说罚款100从工资里扣，这一行为在大多数情况下是不合法的。
法律分析：
法律依据缺失：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。同时，《工资支付暂行规定》第十五条也明确规定了用人单位不得克扣劳动者工资的情形，除非属于法定的代扣情形，如个人所得税、社会保险费用等。因此，主管以罚款为由从工资中扣除100元，不属于法定的代扣工资情形，违反了相关法律规定。
规章制度制定程序不合规：即便公司内有关于上班期间玩手机罚款的规定，但该规定的制定和执行也应遵循合法性和公平性原则，且必须经过职工代表大会或全体职工讨论，与工会或职工代表平等协商确定，并将规章制度公示或告知劳动者。如果这一规定没有经过上述民主程序制定，或者没有向员工公示，那么该规定对员工没有约束力。
罚款措施的合法性存疑：在大多数情况下，用人单位并没有直接的权力对员工进行罚款，除非有特别的法律规定或双方在劳动合同中有明确的约定。如果主管仅因员工上班玩手机就单方面决定罚款，且无法提供充分的法律依据或合同条款支持，则该行为很可能不合法。
应对措施：
与公司协商：首先尝试与公司主管或人力资源部门进行沟通，了解罚款的具体原因和依据，并要求公司提供罚款的法律依据或合同条款。如果公司无法提供合理的解释和依据，你可以表达自己对罚款行为的质疑，并要求公司撤销罚款决定。
寻求法律援助：如果公司坚持执行不合理的罚款决定，你有权拒绝接受罚款，并可向当地的劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在申请劳动仲裁时，你需要准备充分的证据，如罚款通知、工资单、与公司沟通的记录等，以证明公司的罚款行为是不合法的。
保留证据：在整个过程中，务必妥善保留所有与罚款相关的证据，以便在必要时作为维权依据。
综上所述，主管说罚款100从工资里扣的行为，在大多数情况下是不合法的。你有权拒绝接受罚款，并通过合法途径寻求帮助和解决方案。如果你有任何疑问或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。