公司查出员工有肝硬化后，直接辞退员工通常是不合法的。具体分析如下：

1. 法律依据：

   • 根据《劳动合同法》第四十二条，劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。这意味着，如果员工因肝硬化处于医疗期内，公司不能将其辞退。
   • 同时，《劳动合同法》第四十条也规定，即使医疗期满，若员工不能从事原工作也不能从事由用人单位另行安排的工作，用人单位需提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，方可解除劳动合同，并且需要支付经济补偿。

2. 具体情况分析：

   • 如果员工的肝硬化并未影响其工作能力，或者虽然有影响但公司未提供合理的调整工作岗位等机会，就直接辞退员工，这是违反法律规定的。公司应首先评估员工的工作能力，并根据病情合理安排工作。
   • 若员工的肝硬化导致其无法胜任工作，且经过培训或调整工作岗位后仍不能胜任，公司在履行了提前通知或额外支付工资的程序后，可以解除劳动合同，但需支付经济补偿。

3. 法律后果：

   • 如果公司违反法律规定解除或终止劳动合同，员工有权要求继续履行或获得经济补偿标准的二倍作为赔偿金。这是根据《劳动合同法》第四十八条和第八十七条的规定。

综上所述，公司在处理员工肝硬化问题时，应遵守相关法律法规，综合考虑员工的工作能力、医疗期以及是否提供了合理的调整工作岗位等机会。任何辞退行为都应基于充分的法律依据和程序，确保员工的合法权益得到妥善保护。如果你或你身边的人遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会提供专业的法律帮助。