宅基地纠纷协议书在符合法律规定的情况下具有法律效力。具体而言：
- 有效情形：
- 宅基地纠纷协议若是双方真实意思表示，即协议内容反映了双方当事人的真实意愿。
- 协议内容不违反法律法规的强制性规定，例如，未改变宅基地的用途，未违反土地管理法等相关规定。
- 协议主体具有相应的民事行为能力，即双方都是具有完全民事行为能力的自然人或法人。
- 协议不存在欺诈、胁迫等可撤销情形，即协议的签订过程中不存在一方被另一方欺诈、胁迫而违背真实意愿签订的情况。
- 经过了合法的程序，比如双方都进行了签字盖章等操作。
在以上情形下，宅基地纠纷协议通常具有法律效力，能够作为解决纠纷的依据。
无效或可撤销情形：
- 如果协议内容违反法律强制性规定，如违反土地用途管制规定改变宅基地用途等，协议将被认定为无效。
- 如果协议是在一方受欺诈、胁迫违背真实意愿的情况下签订的，受欺诈、胁迫方有权请求撤销协议。
- 如果协议主体不具备民事行为能力，如未成年人、精神病人等签订的协议，也可能被认定为无效或可撤销。
实际操作建议：
- 在签订宅基地纠纷协议前，建议双方当事人充分沟通并协商，确保协议内容真实、合法、有效。
- 如有必要，可以寻求专业律师的协助，对协议内容进行审查和把关，以确保协议的合法性和有效性。
- 在协议履行过程中，如发生争议或纠纷，应及时寻求法律途径解决，以维护自身的合法权益。
综上所述，宅基地纠纷协议书在符合法律规定的情况下具有法律效力。但需要注意的是，协议的有效性并非一成不变，而是取决于多种因素的综合考量。因此，在签订和履行协议时，应严格遵守相关法律法规，并咨询专业人士以确保协议的合法性和有效性。