宅基地合作协议书在符合相关法律法规和政策规定的情况下，通常具有法律效力；但若违反相关规定，则可能无效。以下从不同角度为您详细分析：
有效情况分析
主体资格合法：
- 合作协议的各方必须为同一集体经济组织成员，这是宅基地合作的基本前提。非本集体经济组织成员参与的合作协议，可能因违反土地管理法规而无效。
- 各方应具备完全民事行为能力，能够独立承担民事责任。
协议内容合法：
- 协议内容不得违反法律法规的强制性规定，如不得改变宅基地的用途（如用于商业开发等非居住用途）。
- 协议应体现双方自愿、公平、诚实信用的原则，无欺诈、胁迫等违法情形。
依法办理审批手续：
- 宅基地的使用和合作建房行为必须经过相关部门的审批，包括宅基地审批、规划许可等。
- 合作协议签订后，各方应共同向当地土地管理部门和规划部门申请宅基地使用和合作建房审批，确保建设活动依法依规进行。
遵守“一户一宅”政策：
- 合作建房不得导致任何一方违反“一户一宅”的政策规定，即农村村民一户只能拥有一处宅基地。
无效情况分析
主体资格不合法：
- 如合作协议中有非本集体经济组织成员参与，且未合法取得宅基地使用权，协议将无效。
协议内容违法：
- 协议内容违反法律法规的强制性规定，如改变宅基地用途、违反土地利用总体规划等，将导致协议无效。
未依法办理审批手续：
- 宅基地的使用和合作建房行为未经相关部门审批，或审批未通过，合作协议可能因缺乏合法依据而无效。
违反“一户一宅”政策：
- 合作建房导致其中一方或多方违反“一户一宅”政策，协议将因违反政策规定而无效。
法律建议
签订前充分了解法律法规：
- 在签订宅基地合作协议书前，各方应充分了解相关法律法规和政策规定，确保自身具备合法的主体资格，并依法办理相关审批手续。
协议内容明确具体：
- 协议内容应明确、具体，体现双方的真实意思表示，避免存在欺诈、胁迫等违法情形。可以明确约定合作方式、出资比例、收益分配、风险承担等关键条款。
及时办理审批和变更登记：
- 合作协议签订后，各方应及时向相关部门申请宅基地使用和合作建房审批，并办理宅基地使用权变更登记手续，确保合作建房的合法性。
保留相关证据：
- 在合作过程中，各方应保留好相关证据，如出资凭证、审批文件、变更登记证明等，以备不时之需。
示例说明：
假设甲、乙均为同一集体经济组织成员，双方签订宅基地合作协议书，约定共同出资在甲的宅基地上建房，并明确约定了出资比例、收益分配等条款。同时，双方依法办理了宅基地使用和合作建房审批手续，并办理了宅基地使用权变更登记。在此情况下，该合作协议书通常具有法律效力。
若您在宅基地合作过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议和帮助。