在民事纠纷案件被强制执行多年后，如果还款的话是否可以只还本金，这个问题主要取决于执行依据（如法院判决书、调解书等）的具体内容以及债权人的意愿。

1. 依据执行文书的内容：

   • 如果执行依据明确要求债务人偿还本金及利息、违约金等其他费用，那么债务人必须按照文书的要求全面履行，仅偿还本金是不符合要求的。
   • 如果执行依据仅要求偿还本金，那么债务人只需偿还本金即可。

2. 债权人的意愿：

   • 在某些情况下，债权人和债务人可以达成执行和解协议。如果债权人同意债务人只偿还本金，并签署书面和解协议，那么债务人可以只偿还本金来结清债务。
   • 如果没有达成执行和解协议，或者债权人不同意债务人只偿还本金，那么债务人必须按照执行依据的要求全面履行债务。

综上所述，民事纠纷案件被强制执行多年后，是否可以只还本金并没有一个固定的答案。它取决于执行依据的具体内容以及债权人的意愿。因此，建议债务人在还款前仔细审查执行依据，并与债权人进行充分沟通，以明确还款的具体要求和条件。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。