当员工不从工厂离职时，用人单位需要谨慎处理，以确保遵循相关法律法规，并维护双方的合法权益。以下是一些建议来处理这种情况：

首先，要明确的是，员工不辞而别并不能直接视为“自动离职”。劳动关系的解除需要明确的法律程序，不能仅凭用人单位的单方意愿或员工的消失就断定劳动关系已经解除。因此，当员工不从工厂离职时，用人单位应该采取以下步骤：

1. 尝试联系员工：

   • 通过电话、邮件、短信等多种方式尝试与员工取得联系，了解其不离职的具体原因。
   • 如果员工拒绝沟通或无法联系到，可以记录并保存相关尝试联系的证据。

2. 依据公司规章制度处理：

   • 检查公司的劳动合同和内部规章制度，看是否有关于员工离职的相关规定。
   • 如果员工的行为违反了公司的规章制度（如旷工、无故不上班等），用人单位可以依据规章制度对员工进行相应处理，如警告、罚款或解除劳动合同等。
   • 在处理过程中，要确保遵循法律程序，如提前通知员工、听取员工申辩等。

3. 解除劳动合同：

   • 如果员工长时间不上班且无法联系，用人单位可以依据《劳动合同法》的相关规定，以员工严重违反公司规章制度为由，单方面解除劳动合同。
   • 在解除劳动合同前，要确保已经履行了必要的法律程序，如向员工发送解除劳动合同通知书，并告知其解除劳动合同的原因和依据。
   • 解除劳动合同后，用人单位还需要办理相关手续，如停缴社会保险、办理离职证明等。

4. 避免法律风险：

   • 在处理员工不离职的问题时，用人单位要避免使用“自动离职”等不规范的表述，以免产生法律风险。
   • 如果员工提起仲裁或诉讼，用人单位需要积极应诉，并提供相关证据来支持自己的主张。

5. 寻求法律帮助：

   • 如果用人单位在处理员工不离职的问题时遇到法律难题或纠纷，可以寻求专业律师或法律顾问的帮助。

综上所述，当员工不从工厂离职时，用人单位需要遵循相关法律法规和公司内部规章制度来处理。在处理过程中，要确保遵循法律程序，维护双方的合法权益，并避免产生法律风险。