针对您提出的“交通事故中顶包司机自首后法院会怎么判”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确几个关键点：

1. 顶包行为的性质：在交通事故中，顶包行为属于窝藏、包庇罪。这是因为顶包者明知肇事者犯了罪，却故意为其作假证明进行包庇。

2. 自首的情节：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，犯罪以后自动投案，如实供述自己的罪行的，是自首。对于自首的犯罪分子，可以从轻或者减轻处罚。

接下来，我们根据这些关键点分析法院可能的判决：

1. 对于顶包者：

   • 顶包者因构成窝藏、包庇罪，根据情节轻重，可能面临三年以下有期徒刑、拘役或者管制。
   • 如果情节严重，如顶包行为导致事故责任难以认定，或者给受害者造成了重大损失等，顶包者可能面临三年以上十年以下有期徒刑。

2. 对于肇事者：

   • 肇事者因构成交通肇事罪，需要承担刑事责任。
   • 如果肇事者有自首情节，法院在量刑时会考虑这一因素，并可能给予从轻或减轻处罚。
   • 但需要注意的是，如果交通肇事后果严重，如导致人员死亡或重伤，即使肇事者有自首情节，从轻幅度也可能有限。

此外，还需要注意的是，交通事故中的顶包行为不仅可能构成窝藏、包庇罪，还可能构成妨害作证罪。因为肇事者是出于直接故意，明知自己犯法但为逃避法律追究而积极实施妨害作证行为。

综上所述，交通事故中顶包司机自首后，法院会根据顶包者的行为性质、情节轻重以及肇事者的自首情节等因素进行综合考量，并依法作出判决。具体的判决结果会因案件的具体情况和证据而有所不同。因此，建议涉案人员积极配合调查，如实陈述事实，以便法院能够做出公正、合理的判决。