物业甲方对保洁公司一个项目2万的保证金全部扣除是否合理，需要根据具体情况来判断。以下是从法律角度对这一问题的全面分析：

1. 合同条款的审查：

   • 首先，需要审查物业甲方与保洁公司之间签订的合同，特别是关于保证金的条款。
   • 如果合同中明确规定了保证金扣除的具体条件、方式和金额，并且这些规定不违反法律法规的强制性规定，那么物业甲方按照合同约定扣除保证金可能是合理的。

2. 保证金扣除的合法性：

   • 保证金通常是为了保障合同履行而设定的一种担保方式。
   • 如果保洁公司在合同履行过程中存在违约行为，且该违约行为符合合同中约定的保证金扣除条件，那么物业甲方有权按照约定扣除保证金。
   • 但是，如果保洁公司没有违约，或者违约行为并不符合合同中约定的保证金扣除条件，那么物业甲方无权随意扣除保证金。

3. 保证金扣除的合理性：

   • 即使合同中规定了保证金扣除的条件，物业甲方在扣除保证金时也需要考虑其合理性。
   • 例如，如果保洁公司的违约行为并未给物业甲方造成实际损失，或者造成的损失远小于保证金的金额，那么物业甲方全部扣除保证金可能就显得不合理。
   • 在这种情况下，物业甲方应当根据实际损失情况来扣除保证金，而不是简单地按照合同约定的金额进行扣除。

4. 法律后果与建议：

   • 如果物业甲方无故或不合理地扣除了保洁公司的保证金，保洁公司有权要求物业甲方返还，并可以通过法律途径维护自己的合法权益。
   • 建议保洁公司在与物业甲方协商无果后，及时咨询专业律师，通过法律手段来维护自己的权益。

综上所述，物业甲方对保洁公司一个项目2万的保证金全部扣除是否合理，需要根据合同的具体条款、保证金扣除的合法性以及合理性来综合判断。如果保洁公司认为物业甲方的扣除行为不合理，可以及时向我咨询，我将为你提供专业的法律建议和支持。