双方营运车辆发生交通事故，若符合条件，是可以有停运损失赔偿的。具体分析如下：

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国民法典》第一千一百八十四条：侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。这为营运车辆停运损失的赔偿提供了法律基础，明确停运损失属于财产损失范畴。
2. 《最高人民法院关于审理道路交通事故损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第十二条：明确规定了因道路交通事故造成的合理停运损失，人民法院应予支持。这直接为营运车辆因交通事故导致的停运损失赔偿提供了法律依据。

二. 停运损失赔偿的条件

1. 车辆性质：必须是依法从事货物运输、旅客运输等经营性活动的车辆，即营运车辆。
2. 损失产生原因：必须是因道路交通事故导致车辆无法从事相应经营活动。
3. 损失合理性：停运损失应是合理的，包括停运时间的合理性和损失金额的合理性。停运时间通常以车辆实际维修所需的合理时间为准，损失金额则需根据车辆正常营运时的收入情况来计算。

三. 责任承担主体

1. 侵权人：作为交通事故的责任方，侵权人有义务赔偿受害人因车辆停运而产生的实际收入减少，即合理停运损失。
2. 保险公司：交强险主要赔偿人身伤亡和直接财产损失，间接损失（如停运损失）通常不在赔偿范围内。商业三者险的赔偿范围则需根据保险合同条款确定，若保险合同中明确排除停运损失的赔偿，则由侵权人自行承担。

四. 索赔注意事项

1. 证据收集：受害人需提供充分的证据以证明停运损失的具体数额，包括营运收入证明、车辆维修时间证明等。
2. 法律途径：若双方对赔偿金额无法达成一致，可通过诉讼等法律途径解决。

综上所述，双方营运车辆发生交通事故，若符合条件，受害人是可以依法主张停运损失赔偿的。在索赔过程中，应确保提供充分的证据支持，并通过合法途径维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。