针对您提出的“交通伤对方选择通过司法鉴定，但不同意第二次鉴定，误工费应按第几次的算”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细解答：

首先，误工费是根据受害人的误工时间和收入状况来确定的，而误工时间则主要依据受害人接受治疗的医疗机构出具的证明。如果受害人因伤致残导致持续误工，误工时间可以计算至定残日前一天。这是《最高人民法院关于审理人身损害赔偿案件适用法律若干问题的解释》第二十条所明确规定的。

接下来，关于您提到的两次伤残鉴定的情况。在交通事故案件中，如果进行了两次伤残鉴定，通常是因为第一次鉴定结果存在争议或受害人不服而提出了异议。在这种情况下，法院可能会决定进行第二次鉴定，以更准确地确定受害人的伤残程度。

那么，对于误工费的计算，应该基于哪次鉴定结果呢？一般来说，如果法院采纳了第二次伤残鉴定的结果，那么误工费就应该以第二次鉴定作出的时间来确定。这是因为第二次鉴定通常是在第一次鉴定结果存在争议或不准确的情况下进行的，因此其更具权威性和准确性。

然而，也需要注意到，如果对方不同意第二次鉴定结果，并且提出了合理的异议或理由，那么法院可能会进一步审查或考虑其他证据来确定误工费的计算依据。在这种情况下，法院可能会综合考虑两次鉴定的结果以及其他相关证据，以作出更公正、合理的裁决。

综上所述，如果交通伤事故中进行了两次伤残鉴定，并且法院采纳了第二次鉴定的结果，那么误工费就应该以第二次鉴定作出的时间来确定。但如果对方对第二次鉴定结果有异议，并且提出了合理的理由或证据，法院可能会进一步审查并综合考虑其他因素来作出裁决。因此，在具体案件中，还需要根据法院的裁决和实际情况来确定误工费的计算依据。