合同主体是公司对公司，和代表确实有关系。下面我来详细解释一下：

首先，我们要明确合同主体的概念。合同主体，即合同的当事人，是合同关系的参与者，他们享有合同权利并承担合同义务。在公司对公司的合同中，合同主体自然是两个公司。

然而，公司作为一个法人实体，其行为需要通过自然人来实施，这些自然人通常是公司的法定代表人、授权代表或委托代理人。在这些情况下，代表公司的个人在合同签署和执行过程中起着至关重要的作用。

1. 法定代表人：公司的法定代表人有权代表公司签署合同，其行为视为公司的行为。因此，在合同主体是公司对公司的情况下，如果合同是由双方的法定代表人签署的，那么这份合同就具有法律效力，对双方公司都具有约束力。

2. 授权代表或委托代理人：如果公司不是通过法定代表人签署合同，而是通过授权代表或委托代理人来签署，那么这些代表或代理人在签署合同前需要获得公司的明确授权。他们的行为在授权范围内视为公司的行为，同样对双方公司具有法律约束力。

此外，代表公司的个人在合同履行过程中也扮演着重要角色。他们需要负责合同的执行、监督以及争议解决等工作。如果代表公司的个人在合同履行过程中存在违约行为或不当行为，那么这种行为可能会对公司造成损失，并可能引发法律纠纷。

综上所述，合同主体是公司对公司时，和代表确实有关系。代表公司的个人在合同签署和执行过程中起着至关重要的作用，他们的行为可能直接影响到合同的效力和履行情况。因此，在选择代表公司的个人时，公司需要谨慎考虑并确保他们具备相应的能力和素质。