员工交通工具在单位被损坏的赔偿问题，需要根据具体情况来确定赔偿责任和方式。以下是我根据不同情况给出的分析：

1. 明确责任方：

   • 如果交通工具的损坏是由于单位的其他员工或单位的设施造成的，那么单位或该员工应承担相应的赔偿责任。员工可以先与单位或责任员工进行协商，协商不成时，可以通过法律途径解决。
   • 如果交通工具的损坏是由于第三方的侵权行为造成的，比如外来人员或车辆损坏，那么应由第三方承担赔偿责任。员工可以向第三方主张赔偿，或者通过单位协助追究第三方的责任。

2. 赔偿范围：

   • 赔偿通常包括交通工具的维修费用或重置费用。如果交通工具可以修复，那么赔偿金额应以维修费用为准；如果无法修复或修复成本过高，那么赔偿金额应以重置费用为准。
   • 在某些情况下，如果交通工具的损坏导致了员工的交通不便或额外支出，比如租车费用、打车费用等，这些合理且必要的费用也应纳入赔偿范围。

3. 赔偿程序：

   • 员工在发现交通工具被损坏后，应及时向单位报告，并保留好相关证据，比如照片、视频等。
   • 单位应尽快进行调查，确定责任方，并协助员工与责任方进行协商。
   • 如果协商不成，员工可以通过法律途径解决，比如向人民法院提起诉讼。

4. 特殊情况：

   • 如果单位为员工提供了停车位或交通工具存放区域，并且收取了相关费用，那么单位在管理上应承担一定的责任。如果交通工具在这些区域内被损坏，单位可能需要承担一定的赔偿责任。
   • 如果交通工具的损坏是由于自然灾害等不可抗力因素造成的，那么通常不追究责任方的赔偿责任。但单位可以协助员工向保险公司申请理赔。

综上所述，员工交通工具在单位被损坏的赔偿问题需要根据具体情况来确定。如果员工在赔偿过程中遇到任何困难或疑问，可以随时向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律建议。