村规民约中明确建房保证金的用途、退还条件和扣除标准等规定是合法且必要的。以下是对此问题的详细分析：

一. 村规民约的法律效力

• 根据相关法律法规，村民委员会是村民自我管理、自我教育、自我服务的基层群众性自治组织，实行民主选举、民主决策、民主管理、民主监督。村民委员会向村民会议、村民代表会议负责并报告工作。
• 因此，村规民约作为村民自治的产物，在符合法律法规的前提下，对全体村民具有约束力。

二. 建房保证金的用途

• 村规民约中应明确建房保证金的用途，如确保工程质量达到相应标准、遵守村庄规划、风貌建设要求等。
• 保证金应专款专用，不得挪作他用，以确保其用于公共事务及公益事业。

三. 建房保证金的退还条件

• 村规民约中应明确建房保证金的退还条件，如建房申请人严格遵循了相关规定和建筑风格，未出现违规情况。
• 一般来说，房屋建成后经相关部门验收合格，且建房申请人未违反任何规定，即可申请退还保证金。

四. 建房保证金的扣除标准

• 村规民约中还应明确建房保证金的扣除标准，如建房申请人违反规定进行违法建设、擅自改变建筑户型和建筑风格等。
• 在扣除保证金时，应确保有明确的依据和合理的标准，避免随意扣除或滥用保证金。

五. 公开透明与村民知情权

• 在建房保证金的收取、使用和退还过程中，村委会应确保公开透明，接受村民的监督。
• 村委会应明确告知村民保证金的具体用途、退还条件以及扣除标准等信息，以保障村民的知情权。

六. 村民的申诉与法律援助权利

• 若村民对于保证金的收取、使用或退还存在疑虑或不满情绪，他们应享有向相关部门提出申诉或寻求法律援助的权利。

综上所述，村规民约中明确建房保证金的用途、退还条件和扣除标准等规定是确保村民建房活动有序进行、维护村民合法权益的重要举措。我建议村委会在制定和执行相关规定时，务必遵循法律法规，确保公开透明、合理合法。如有进一步需要，您可以继续咨询我。