当单位在与劳动者连续订立两次固定期限劳动合同后选择不续签时，赔偿问题的处理需遵循《劳动合同法》的相关规定。以下是对此问题的详细解答：

一、赔偿原则

1. 单位不续签且劳动者无过错：

   • 在这种情况下，单位不续签劳动合同属于违法解除劳动合同，劳动者有权要求单位按经济补偿标准的二倍支付赔偿金。

2. 劳动者不续签：

   • 如果单位维持或提高了劳动合同约定的条件，而劳动者选择不续签，那么单位通常无需支付经济补偿。
   • 但如果单位降低了劳动条件导致劳动者不续签，单位则需要支付经济补偿。

二、经济补偿的计算

• 经济补偿标准：按劳动者在本单位工作的年限来计算，具体为每满一年支付一个月工资；六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，则支付半个月工资。这里的“月工资”指的是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资。

• 特殊情况：对于符合签订无固定期限劳动合同条件的劳动者，如果单位不续签，除了上述经济补偿外，还需自应签订无固定期限劳动合同之日起每月支付二倍的工资作为赔偿金。

三、劳动者的应对措施

1. 证据收集：劳动者应及时收集能证明劳动关系、工作年限、工资水平等相关证据，如劳动合同、工资条、考勤记录等，以备不时之需。

2. 协商与投诉：

   • 首先尝试与单位进行协商，明确指出单位的行为可能违法，并要求依法支付赔偿金。
   • 如果协商不成，劳动者可以向当地的劳动监察部门投诉，或申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。

3. 法律途径：在必要时，劳动者可以通过法律途径来寻求救济，包括向法院提起诉讼。

四、实例说明

假设一个劳动者在某单位工作了3年，月平均工资为5000元。如果该劳动者在连续订立两次固定期限劳动合同后，单位选择不续签且没有其他合法理由，那么该劳动者可以获得的赔偿金计算如下：3年（工作年限）× 5000元（月工资）× 2（二倍经济补偿标准）= 30000元。

综上所述，当单位在签订两次合同后不续签时，劳动者应了解自己的权益和赔偿原则，及时采取措施来维护自己的合法权益。如果遇到困难或疑问，建议咨询专业律师或相关机构以获取更具体的法律意见和帮助。