包工头拖欠工资超过三个月是违法的。下面我将从法律法规、农民工的权益保护、维权途径以及法律后果等角度为您详细解释。

一、法律法规依据

1. 《中华人民共和国劳动法》第五十条规定：“工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。”这一条款明确保护了劳动者的工资权益，包括农民工。

2. 《中华人民共和国劳动合同法》第三十条也规定：“用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬。”即使农民工与包工头之间未签订正式劳动合同，但只要存在事实劳动关系，该法同样适用。

3. 《保障农民工工资支付条例》更是专门针对农民工工资权益的行政法规，明确规定了用人单位和包工头按时足额支付农民工工资的法定义务。

二、农民工的权益保护

农民工在付出劳动后，有权获得相应的报酬。包工头作为雇佣方，有义务按照约定或法律规定支付工资。拖欠工资行为不仅侵犯了农民工的劳动报酬权，还违反了上述法律法规的明确规定。

三、维权途径

当农民工遭遇包工头拖欠工资时，可通过以下途径维护自身权益：

1. 向劳动监察部门投诉：劳动监察部门有权对拖欠工资行为进行查处，责令包工头限期支付工资，并可对其施以行政处罚。

2. 申请劳动仲裁或向法院起诉：农民工可以持相关证据（如工资欠条、工作记录等）向当地劳动争议仲裁委员会申请仲裁，或者直接向法院起诉，要求包工头支付工资。

3. 寻求工会组织帮助：工会组织可以提供法律援助和协调解决工资拖欠问题。

四、法律后果

如果包工头恶意拖欠工资且数额较大，还可能构成拒不支付劳动报酬罪，将面临刑事处罚。根据相关规定，拒不支付一名劳动者三个月以上的工资，数额在五千元至两万元以上，或者拒不支付十名以上劳动者工资，数额累计在三万元至十万元以上，就达到了“数额较大”的标准。

综上所述，包工头拖欠农民工工资超过三个月是明确的违法行为。农民工应积极运用法律手段维护自身权益，同时包工头也应增强法律意识，履行支付工资的法定义务，避免引发不必要的法律纠纷和严重后果。如果您遇到类似问题，可以直接向我咨询，我会为您提供专业的法律帮助。