工厂请假扣双薪是否合法，需根据具体情况判断。以下是详细的分析：
一般情况下不合法：
- 根据《关于工资支付暂行规定》第十五条，用人单位不得随意克扣劳动者工资。请假并不属于法定允许扣除工资的情形，因此，工厂在员工请假时扣双薪，通常会被视为违反了相关法律法规，从而判定为不合法。
特殊情况下可能合法：
- 如果劳动合同中有明确约定，且该约定不违反法律、法规的强制性规定，同时用人单位的扣除方式是基于合理的管理制度（如因员工请假导致企业遭受了额外的、可量化的经济损失，并能提供相应证据），并且事先告知了员工，那么这种双倍扣除方式可能会被认定为有效。但这种情况需要满足严格的条件，包括规定的合法性、员工的知情同意以及管理制度的合理性。
应对建议
- 了解规定：劳动者应首先了解工厂关于请假的具体规定，以及这些规定是否合法。
- 协商沟通：如果认为工厂的规定不合法或不合理，应与工厂进行协商沟通，要求按照合法的方式计算工资。
- 法律维权：若协商不成，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁来维护自己的合法权益。在必要时，也可以提起诉讼。
综上所述，工厂请假扣双薪的合法性取决于多个因素。劳动者在遇到此类情况时，应了解自己的权益和法律规定，通过合法途径维护自己的权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。