当事业单位工作人员年底考核不合格并对此有异议时，可以按照以下步骤进行申诉：

一、提出复核申请

首先，您需要在知道考核结果之日起三十日内向所在单位提出复核申请。请确保您的申请内容明确，并附上相关证据或理由，以支持您对考核结果的异议。单位应当受理您的复核申请，并在规定的时间内进行复核。

二、申诉至主管部门

如果您对单位作出的复核决定不服，可以在收到复核决定书之日起三十日内，向所在单位的主管部门提出申诉。在申诉时，请提供复核决定书及您的申诉理由和相关证据。主管部门应当受理您的申诉，并进行调查和处理。

三、再申诉至同级事业单位人事综合管理部门

如果您对主管部门的申诉处理决定仍然不服，可以在收到申诉处理决定书之日起三十日内，向同级事业单位人事综合管理部门提出再申诉申请。再申诉是最终的申诉环节，您需要提供之前所有的申诉材料和决定，以及您新的申诉理由和证据。同级事业单位人事综合管理部门应当受理您的再申诉，并作出最终决定。

四、注意事项

1. 时间限制：请务必在规定的时间内提出复核、申诉和再申诉，以免错过申诉的时机。
2. 证据准备：在申诉过程中，提供充分的证据和理由来支持您的异议是非常重要的。
3. 了解法规：熟悉《事业单位人事管理条例》、《事业单位工作人员申诉规定》等相关法规，以便更好地维护您的权益。

通过以上步骤，您可以对年底考核不合格的结果进行申诉，并寻求公正的处理。希望这些信息能对您有所帮助。