关于因招标人自身原因致使未能与中标人签订合同的赔偿金计算方法，以下是我的详细解答：

结论前置：

因招标人自身原因未能与中标人签订合同，赔偿金的计算通常包括退还投标保证金、标书费以及其他实际损失。具体数额需根据双方实际情况和证据来确定，并可能受到法院或仲裁机构的裁量。

分析说明：

1. 预约合同关系与违约责任：

   • 招标人向中标人发出中标通知书后，双方形成预约合同关系。若招标人单方拒绝与中标人签订正式合同，则视为违反预约合同义务，中标人有权要求其承担违约责任。

2. 赔偿金的组成：

   • 投标保证金与标书费：招标人应退还中标人缴纳的投标保证金和标书费。这是中标人的直接经济损失，也是赔偿金的组成部分。
   • 其他实际损失：中标人因准备履行合同而产生的实际损失，如采购零件、租赁设备、组织人员等费用，也应由招标人赔偿。但需要注意的是，中标人需提供充分证据来证明这些损失与招标人的违约行为之间存在因果关系。

3. 赔偿金的计算：

   • 投标保证金和标书费的退还数额以中标人实际缴纳的金额为准。
   • 其他实际损失的计算需根据中标人提供的证据来确定。法院或仲裁机构在裁决时会考虑损失的合理性、必要性以及与招标人违约行为的关联性。

4. 法律依据：

   • 《中华人民共和国民法典》第四百九十五条第二款规定：“当事人一方不履行预约合同约定的订立合同义务的，对方可以请求其承担预约合同的违约责任。”
   • 《中华人民共和国招标投标法》及相关行政法规也对招标人的违约行为及其法律责任进行了规定。

5. 实际案例：

   • 以兰州市新区法院审理的某案为例，法院根据双方的实际情况和证据，判决招标人退还中标人的投标保证金、投标文件费，并赔偿中标人为履行合同而产生的部分实际损失。该案例体现了法院在裁决此类纠纷时的裁量和判断。

总结：

因招标人自身原因未能与中标人签订合同，赔偿金的计算应综合考虑投标保证金、标书费以及其他实际损失。中标人需提供充分证据来证明自己的损失，并依法向招标人主张赔偿责任。若双方无法协商解决，可诉诸法院或仲裁机构进行裁决。