工程变更手续不合规，可能违反了《中华人民共和国建筑法》以及相关法律法规中关于工程建设程序和管理的规定。具体来说：

1. 《中华人民共和国建筑法》：该法规定了建筑工程从规划、设计、施工到竣工验收等各个环节的法定程序和要求。如果工程变更未按照法定程序进行审批或者备案，就可能违反了该法的相关规定。例如，建筑法明确规定了建筑工程施工图设计文件需要经过审查批准，如果变更设计未重新报审或未经批准，即属于违规行为。

2. 相关行政法规和部门规章：除了建筑法，国务院及其相关部门还制定了一系列行政法规和部门规章，对工程建设中的变更管理进行了细化规定。如《建筑工程施工许可管理办法》等，这些规章可能具体规定了工程变更的申报、审批流程以及所需提交的材料等。如果工程变更手续未按照这些规定执行，同样构成违规。

3. 地方性法规和地方政府规章：在不同地区，地方政府还可能根据本地实际情况，制定地方性法规和地方政府规章，对工程建设中的变更管理提出具体要求。如果工程所在地的相关法规或规章中有关于工程变更的特别规定，而变更手续未遵守这些规定，也会被视为违规行为。

综上所述，工程变更手续不合规可能违反的法规是多方面的，具体需要根据实际情况来判断。如果你遇到了具体的工程变更问题，可以详细向我说明情况，我将为你提供更具体的法律分析和建议。