企业可以用函发给行政部门。具体分析如下：

一. 企业发函的合法性

1. 企业发函的权利：企业作为法人实体，有权利向包括行政部门在内的各类机构发送正式函件。这种函件通常用于正式沟通、提出请求、反馈意见或表达立场。
2. 法律依据：虽然具体的法律条文中可能并未直接规定企业可以向行政部门发函，但根据《中华人民共和国民法典》等相关法律法规，企业作为法人享有广泛的民事权利，包括通信自由，这为企业向行政部门发函提供了法律基础。

二. 企业向行政部门发函的实际情况

1. 常见场景：企业在日常运营中，经常需要与政府行政部门进行沟通，如申请行政许可、反映问题、提出建议等。这时，发送正式函件是一种常见且有效的沟通方式。
2. 函件内容：企业向行政部门发送的函件应包含明确的收件人、发件人、函件主题、正文内容以及落款等要素。正文内容应清晰、准确地表达企业的意图或需求，并附上必要的附件或证明材料。

三. 发函的注意事项

1. 格式规范：企业向行政部门发函时，应遵守相应的格式规范，确保函件的专业性和正式性。这有助于提升企业在行政部门心中的形象，也有利于函件得到及时、有效的处理。
2. 尊重与礼貌：在函件中，企业应表现出对行政部门的尊重与礼貌，避免使用过于强硬或不当的言辞。这有助于建立良好的沟通氛围，促进问题的顺利解决。

综上所述，企业完全可以用函发给行政部门，这是企业与行政部门进行正式沟通的一种有效方式。我建议企业在发函时，务必遵守格式规范，注重内容的准确性和礼貌性，以确保函件得到及时、有效的处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。