若双方对货款付款时间没有约定，法院一般会判决买方在合理时间内支付货款，且卖方的起诉不会因超过诉讼时效而被驳回。具体分析如下：
一. 付款时间未做约定的处理
- 合同变更与履行：根据本案例，被告公司虽初期表示货款实行月结，但后续付款并未按照月结方式履行，且原告未提出异议。这表明双方在合同履行过程中，已实际变更了付款方式的约定，付款时间未作明确约定。
- 随时主张权利：由于付款时间未作明确约定，原告作为卖方，有权在合理时间内随时向被告主张支付货款。此处的“合理时间”通常指给予被告必要的准备时间，以筹集资金并支付货款。
- 诉讼时效的适用：在本案例中，由于付款时间未作约定，被告以诉讼时效为由提起抗辩未被法院采纳。这意味着，在付款时间未约定的情况下，卖方不会因为超过某个固定期间（如三年）而丧失向法院起诉要求支付货款的权利。
二. 法律依据与实际应用
- 虽然此处的分析未直接引用具体法条，但根据民法典关于合同履行的相关规定，以及诉讼时效的适用原则，可以推断出上述结论。在实际应用中，法院会综合考虑合同的实际履行情况、当事人的行为以及公平原则，作出合理的判决。
三. 结论与建议
- 结论：因此，若双方对货款付款时间没有约定，法院会判决买方在合理时间内支付货款，且卖方的起诉不会因超过诉讼时效而被驳回。
- 建议：为避免类似纠纷，建议双方在签订合同时，明确约定付款时间、方式及违约责任等条款，以确保合同的有效履行。如有进一步需要，您可以继续咨询我。