在离婚诉讼中，是否可以让法官开一份证明让被告在规定时间内归还出生证明和疫苗本，这个问题涉及到法律程序与实际操作的可能性。首先，我们要明确一点，法院的主要职责是审理案件并作出判决，而不是直接介入当事人的个人事务或物品交换。

针对您的情况，如果出生证明和疫苗本是由被告持有，并且您认为这些物品对您的权益有重要影响（比如孩子的抚养权、疫苗接种等），您可以在离婚诉讼中向法院提出相关请求，要求法院在判决中明确这些物品的归属和交接方式。法院在审理过程中，会根据双方提供的证据和法律规定，对物品归属作出判决，并可能要求一方在特定时间内将物品交付给另一方。

然而，需要注意的是，法院并不会直接开具一份证明要求被告归还这些物品。相反，它会通过判决的形式来明确双方的权利和义务。如果判决生效后，被告仍然不履行交接义务，您可以通过申请强制执行等法律手段来维护自己的权益。

另外，关于您提到的参考信息中的案例，虽然法院在特定情况下可能会督促相关机构履行其法定职责（如出具出生医学证明），但这并不意味着法院会直接介入个人物品的交换或归还。每个案件都有其独特性和复杂性，因此具体的法律程序和结果也会因案而异。

综上所述，如果您希望在离婚诉讼中解决出生证明和疫苗本的归属问题，建议您在诉讼过程中明确提出相关请求，并提供充分的证据来支持您的主张。法院会根据法律规定和案件事实作出公正的判决。