中医诊所将中药研磨成粉装瓶的行为，在特定情况下并不违法。以下是对此问题的详细分析：

1. 合法情形：

   • 根据相关规定，将中药材精细研磨为粉末状，并在医疗机构内部由专业医护人员进行调配和使用，这一行为并不在国家药物研发和生产的管制范畴内。因此，如果中医诊所是按照医生开具的特定处方（因人而异的处方），遵循中药传统工艺将中药研磨成粉并装瓶，且仅供该医疗机构内部使用，那么这一行为是合法的。

2. 可能违法的情形：

   • 如果中医诊所将研磨成粉的中药进行大规模生产、销售或推广，或者未按照医生开具的特定处方进行研磨，而是随意将多种中药混合研磨成粉，那么这一行为可能涉及非法制药或销售未经批准的药品，从而构成违法。
   • 此外，如果研磨过程中存在卫生条件不达标、药品质量不合格等问题，也可能导致违法行为的产生。

3. 建议与注意事项：

   • 中医诊所在进行中药研磨成粉装瓶的行为时，应确保遵循相关法律法规和医疗规范，确保药品的质量和安全性。
   • 如需进行大规模生产或销售，应依法取得相关资质和批准文件。
   • 诊所应加强对医护人员的培训和管理，确保他们具备专业的中药知识和操作技能。

综上所述，中医诊所将中药研磨成粉装瓶的行为在特定情况下是合法的，但也可能存在违法的情形。因此，诊所在进行此类行为时应谨慎操作，确保合规性。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。