要杜绝工程部员工将公司财物据为己有，需要从制度建设、员工教育、监督管理以及法律惩戒等多方面综合施策。

一. 完善公司管理制度

1. 建立严格的财物管理制度：明确公司财物的登记、使用、保管和报废流程，确保每一笔财物都有明确的记录和责任人。例如，设立专门的财物管理部门，负责财物的采购、入库、出库和盘点等工作，确保财物的流向清晰可查。
2. 制定员工行为规范：在公司规章制度中明确禁止员工私自占有公司财物，并规定相应的处罚措施。这可以作为一种威慑，让员工明白违规的后果。

二. 加强员工教育和培训

1. 开展法制教育：定期组织员工学习相关法律法规，如《刑法》中关于职务侵占罪的规定，让员工了解私自占有公司财物的法律后果。
2. 培养职业道德：通过企业文化建设和职业道德培训，引导员工树立正确的价值观，增强对公司的归属感和责任感。

三. 强化监督管理

1. 定期盘点和审计：定期对工程部的财物进行盘点和审计，确保财物的数量和价值与账目相符。如发现异常，应及时调查并处理。
2. 设立举报机制：鼓励员工之间相互监督，设立举报渠道，对举报属实的情况给予奖励，以激发员工的监督积极性。

四. 法律惩戒

1. 明确法律后果：根据《刑法》第二百七十一条的规定，公司、企业或者其他单位的工作人员，利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大的，处三年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；数额巨大的，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大的，处十年以上有期徒刑或者无期徒刑，并处罚金。这一法律规定为打击职务侵占行为提供了有力的法律武器。
2. 及时报案和追诉：一旦发现员工有私自占有公司财物的行为，公司应立即向公安机关报案，并积极配合调查取证工作，确保违法者受到应有的法律制裁。

我建议公司从上述四个方面入手，通过完善制度、加强教育、强化监督和法律惩戒等多措并举，来有效杜绝工程部员工将公司财物据为己有的行为。如有进一步需要，您可以继续咨询我。