首先，我要明确告诉你，偷拿母亲存在你名下的45万，即使后来及时还上并取得了母亲的谅解，这种行为在法律上也是不被允许的，因为它涉及到了侵犯他人财产权的问题。不过，考虑到你的实际情况和后续行为，我们可以从以下几个方面来分析可能的法律后果：

1. 刑事责任：

   • 在一般情况下，盗窃他人财物数额较大的，会构成盗窃罪，需要承担刑事责任。但考虑到你及时归还了款项，并取得了母亲的谅解，这在一定程度上可以视为有悔罪表现。
   • 如果母亲明确表示不追究你的刑事责任，且公安机关未介入，那么你可能不会面临刑事追诉。但请注意，这并不意味着你的行为没有法律后果。

2. 民事责任：

   • 从民事角度来看，你仍然需要对你母亲承担一定的责任。虽然你归还了款项，但你的行为已经给她造成了精神上的困扰和可能的经济损失（如利息损失、精神损害赔偿等）。
   • 如果母亲没有提出具体的民事赔偿要求，你们可以协商处理此事，比如你可以通过道歉、补偿等方式来弥补她的损失。

3. 家庭关系：

   • 除了法律后果外，你还需要考虑这种行为对家庭关系的影响。偷拿家人的钱财会严重损害家庭信任和亲情关系。
   • 你需要认真反思自己的行为，向母亲诚恳道歉，并努力修复因你的行为而受损的家庭关系。

综上所述，虽然你及时归还了款项并取得了母亲的谅解，但你的行为仍然涉及到了法律问题。我建议你认真反思自己的行为，加强法律意识，尊重他人的财产权。同时，你也需要积极采取措施来修复因你的行为而受损的家庭关系。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。