职工意外交通事故死亡司法调解机构可以对工伤赔偿进行调解。具体来说：

1. 调解机构的职责：司法调解机构，如人民调解委员会等，其职责就是调解各类民事纠纷，包括因工伤赔偿引发的争议。在职工因意外交通事故死亡后，如果涉及工伤赔偿问题，相关当事人可以向司法调解机构申请调解。

2. 工伤赔偿的调解：在调解过程中，调解机构会听取双方当事人的意见和诉求，了解事故经过、工伤认定情况、赔偿标准等关键信息，并依据相关法律法规和政策规定，对赔偿问题进行公正、合理的调解。如果调解成功，双方当事人可以签订调解协议，明确赔偿金额、支付方式等具体内容，从而解决工伤赔偿争议。

3. 调解的效力：经过司法调解机构调解达成的调解协议，具有法律约束力。如果一方当事人不履行调解协议，另一方当事人可以向人民法院申请强制执行，维护自己的合法权益。

综上所述，职工意外交通事故死亡后，司法调解机构可以对工伤赔偿进行调解，以帮助双方当事人解决争议，维护社会稳定和谐。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的帮助，请直接向我咨询。