员工利用公司会员卡积分造成损失，老板扣员工工资是否合法，需具体情况具体分析。

首先，我们要明确的是，工资是员工提供劳动后应得的报酬，受到法律的保护。老板不能随意扣减员工的工资，除非有合法的理由和明确的依据。

1. 若公司有明确规定：

   • 如果公司在劳动合同、员工手册或其他规章制度中明确规定，员工利用公司资源（包括会员卡积分）造成损失需要承担相应责任，且这种规定不违反法律法规，那么老板根据这些规定扣减员工工资可能是合法的。
   • 但即便如此，老板在扣减工资时也需要遵循一定的程序，如提前通知员工、给予员工申辩的机会等，并确保扣减的金额合理且与员工的过错程度相匹配。

2. 若公司无明确规定：

   • 如果公司没有相关规定，或者规定不明确、不合法，那么老板扣减员工工资的行为可能是违法的。
   • 在这种情况下，员工有权要求老板说明扣减工资的理由，并可以通过法律途径维护自己的权益。

此外，无论公司是否有相关规定，老板在扣减员工工资时都需要确保不违反最低工资标准、不侵犯员工的基本生活权益，并且不能违反劳动法的其他相关规定。

综上所述，员工利用公司会员卡积分造成损失后，老板扣员工工资是否合法取决于公司是否有合法且明确的相关规定，以及老板在扣减工资时是否遵循了合法的程序。如果你对此类问题有疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。