工伤认定并不需要等待治疗结束。

根据《工伤认定办法》的相关规定，职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病时，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。这一规定明确了工伤认定的时间起点是事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日，而非治疗结束之日。

同时，该办法也规定了用人单位未在规定时限内提出工伤认定申请的情况下，受伤害职工或者其近亲属、工会组织可以在事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起1年内直接提出工伤认定申请。这一规定进一步保障了职工的权益，确保他们能够在合理的时间内获得工伤认定。

因此，工伤认定并不依赖于治疗是否结束，而是基于事故伤害发生或职业病诊断的事实。职工在受伤或确诊职业病后，应尽快按照相关规定向社会保险行政部门提出工伤认定申请，以便及时获得工伤认定和相应的工伤保险待遇。