当公司破产且员工正处于医疗期时，赔偿问题是一个需要细致处理的事项。以下是对这一问题的详细解答：
一、破产财产清偿顺序
根据《企业破产法》的相关规定，公司破产后，其破产财产需按照一定的顺序进行清偿。首先，要优先清偿破产费用和共益债务。随后，需支付职工的工资、医疗与伤残补助、抚恤费用，以及应划入职工个人账户的基本养老保险、基本医疗保险费用。最后，支付法律和行政法规规定应支付给职工的补偿金。
二、医疗期内员工经济补偿计算
病假工资或疾病救济费：在医疗期内，公司应按照规定支付员工病假工资或疾病救济费，这是员工的基本权益。
经济补偿：对于医疗期内的员工，公司破产时还需支付经济补偿。经济补偿的计算依据是员工在本单位的工作年限。具体来说，工作每满一年，支付一个月工资作为经济补偿；工作六个月以上不满一年的，按一年计算，支付一个月工资；工作不满六个月的，支付半个月工资作为经济补偿。
最高限额：若员工的月工资高于用人单位所在直辖市、设区的市级人民政府公布的本地区上年度职工月平均工资的三倍，那么支付经济补偿的标准将按职工月平均工资的三倍数额计算。同时，支付年限最高不超过十二年。
三、注意事项
医疗费用结算：如果员工在医疗期内的医疗费用尚未结清，公司应予以结算，确保员工的医疗费用得到妥善处理。
债权申报：员工可依法依规向破产管理人申报债权，以维护自身的合法权益。在申报债权时，需提供相关证据材料，如医疗证明、工资单等，以证明自己的权益。
综上所述，当公司破产且员工处于医疗期时，公司应按照规定支付员工的病假工资或疾病救济费，并根据员工在本单位的工作年限支付经济补偿。同时，员工也需依法依规向破产管理人申报债权，以维护自身的合法权益。